複合体マルチコンフォーメーション解析
| WaterHall |
| 開発責任者 |
山下 雄史（東京大学 先端科学技術研究センター 特任准教授） |
| MDシミュレーションで得られる構造ファイル群に対して、計算位相幾何学的にタンパク質周囲の水分子分布を特徴付ける |
| GENESIS |
| 開発責任者 |
杉田有治（理化学研究所開拓研究本部 杉田理論分子研究室 主任研究員） |
| タンパク質、膜、核酸、糖鎖など、生体内分子系のための分子動力学ソフトウェア |
| ColDock |
| 開発責任者 |
北尾 彰朗 (東京工業大学 生命理工学院 教授) |
| タンパク質と低分子の複合体立体構造を全原子モデルで高速に予測する |
| dPaCS-MDMSM |
| 開発責任者 |
北尾 彰朗 (東京工業大学 生命理工学院 教授) |
| タンパク質複合体の解離シミュレーションによってタンパク質複合体の結合エネルギー・解離速度定数・結合速度定数を計算。 |
| QM/MM RWFE-SCF 法 |
| 開発責任者 |
林 重彦（京都大学大学院理学研究科 教授） |
| 非経験的量子化学計算と長時間分子動力学シミュレーションを組み合わせた確率的最適化手法により、機能活性部位の電子状態と分子構造を精度よく決定する |
その他の計算手法を見る場合は、下記のフロー図より選択してください。
創薬ビッグデータ統合システムのフロー
