結合自由エネルギー計算

MP-CAFEE （Massively Parallel Computation of Absolute binding Free Energy with well-Equilibrated states）
開発責任者	（故）藤谷 秀章（東京大学 先端科学技術研究センター 特任教授）
標的タンパク質と低分子量有機化合物の結合親和性（結合自由エネルギー）を大規模分子動力学シミュレーションによって精密に計算する

FUJI force field
開発責任者	故 藤谷 秀章（東京大学 先端科学技術研究センター 特任教授）
高精度タンパク質力場

GENESIS
開発責任者	杉田有治（理化学研究所開拓研究本部 杉田理論分子研究室　主任研究員）
タンパク質、膜、核酸、糖鎖など、生体内分子系のための分子動力学ソフトウェア

Free Energy Perturbation (FEP)
開発責任者	杉田有治（理化学研究所開拓研究本部 杉田理論分子研究室　主任研究員）
標的タンパク質とリガンドの結合親和性を精密に計算する

その他の計算手法を見る場合は、下記のフロー図より選択してください。

　　　

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