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伊藤 祐子（いとう ゆうこ） |
佐賀県出身 |
研究紹介
薬には、副作用という問題があり、時にはそれが重篤な症状を引き起こす場合もあります。副作用の原因の一つに、薬が標的とは別のタンパク質の触媒サイトに作用することがあります。この現象は、触媒サイトがタンパク質間で類似しているために起こり、結果として生命活動に悪い影響を与えます。したがって、副作用が少ない薬剤開発を目指すには、通常の触媒活性サイトとは異なる部位にありながら、タンパク質の機能に決定的な影響を与える部位（アロステリック部位）での創薬が有効です。しかし、アロステリック部位はタンパク質の機能を間接的に制御するために、立体構造からは非自明であり、その創薬の成功例は少ないのが現状です。私は、これまで分子モーター(F1-ATPase)の構造変化の研究を行ってきました[1][2][3][4][5]。そこで得た手法や経験を、副作用が少ない薬の探索に役立てるため、現在、病気に関わる蛋白質の構造変化の研究を行っています。その中で、構造変化の途中で一時的に現れる、触媒活性部位とは別のアロステリック部位を探し出し、さらにそこに結合しタンパク質の機能を制御する化合物を選び出すことで、選択性が高い(副作用が少ない)薬の”種”を得ようとしています。
※[1][2][3][4][5]は主要論文を参考
■研究分野
・生体分子のシミュレーション
■研究課題
・創薬に関わるタンパク質の研究 (2017～)
・F1-ATPaseの回転機構 (2008～2015)
・P450の薬物結合 (2004～2008)
・Biotincarboxylaseの化学反応経路 (2003～2007)
■研究キーワード
分子動力学計算、タンパク質の構造変化
主要論文・活動実績
■主要論文[1] “The Mechanism of the ab Conformational Change in F1-ATPase After the ATP Hydrolysis: Free-energy Simulation”, Yuko Ito, Mitsunori Ikeguchi, Biophysical J., vol.108,1, pp.85-97, 2015.1,DOI: 10.1016/j.bpj.2014.11.1853
[2] “Molecular Dynamics Simulations of Yeast F1-ATPase Before and After 16-degree Rotation of the Gamma Subunit”, Yuko Ito, Takashi Yoshidome, Nobuyuki Matubayashi, Masahiro Kinoshita, Mitsunori Ikeguchi, The Journal of Physical Chemistry B, vol.117,12, pp. 3298-3307, 2013.3,DOI: 10.1021/jp312499u
[3] “Mechanism of the Conformational Change of the F1-ATPase b subunit Revealed by Free Energy Simulations”, Yuko Ito, Oroguchi Tomotaka, Mitsunori Ikeguchi, Journal of the American Chemical Society, vol.133,10, pp.3372-3380, 2011.2,DOI:
10.1021/ja1070152
[4] “Molecular Dynamics Simulations of the Isolated b Subunit of F1-ATPase”, Yuko Ito, Mitsunori Ikeguchi, Chemical Physics Letters, vol.490,1-3, pp.80-83, 2010.4,DOI:
10.1016/j.cplett.2010.03.015
[5] “Structural Fluctuation and Concerted Motions in F1-ATPase: a Molecular Dynamics Study”, Yuko Ito, Mitsunori Ikeguchi, Journal of Computational Chemistry, vol.31,11, pp.2175-2185, 2010.3,DOI: 10.1002/jcc.21508
[6] “Theoretical Analysis of the Reaction Mechanism of Biotin Carboxylase”, Yuko Ito, Hiroki Kondo, Yoshihito Shiota, Kazunari Yoshizawa, Journal of Chemical Theory and Computation, vol.4,2, pp.366–374, 2008.2,DOI: 10.1021/ct700260f
[7] “Analysis of CYP2D6 Substrate Interactions by Computational Methods”, Yuko Ito, Hiroki Kondo, Peter S. Goldfarb, David F.V. Lewis, Journal of Molecular Graphics and Modelling, vol.26,6, pp.947–956, 2008.2,DOI: 10.1016/j.jmgm.2007.07.004
自己紹介
■学歴
九州工業大学情報工学部（飛級中退）
九州工業大学情報工学研究科博士後期課程（満期退学）
博士（情報工学）
■所属学会
・生物物理学会
・CBI学会
（2018/8/31記録）
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